Die Federführung und Gesamtverantwortung für das Vorhaben hat der Bundestag der Bundesregierung aufgetragen, sie wird durch den Beauftragten der Bundesregierung für Kultur und Medien, Wolfram Weimer, wahrgenommen. Die Bundestiftung zur Aufarbeitung der SED-Diktatur wurde von dem BKM beauftragt, das Vorhaben in engem Zusammenwirken mit der UOKG vorzubereiten und seine Umsetzung zu begleiten. Hierzu wurde eine, bei der Bundesstiftung angesiedelte, Koordinierungsstelle eingerichtet. Ein neunköpfiger Beirat unterstützt die Koordinierungsstelle bei dieser Aufgabe.