Die Federführung und Gesamtverantwortung für das Vorhaben hat der Bundestag der Bundesregierung aufgetragen, sie wird durch die Beauftragte der Bundesregierung für Kultur und Medien, Claudia Roth, wahrgenommen. Die Bundestiftung zur Aufarbeitung der SED-Diktatur wurde von der BKM beauftragt, das Vorhaben in engem Zusammenwirken mit der UOKG vorzubereiten und seine Umsetzung zu begleiten. Hierzu wurde eine, bei der Bundesstiftung angesiedelte, Koordinierungsstelle eingerichtet. Ein neunköpfiger Beirat unterstützt die Koordinierungsstelle bei dieser Aufgabe.